A Reitoria é o órgão executivo e normativo superior da UNIRIO que coordena e superintende todas as suas atividades, competindo-lhe definir as políticas institucionais, elaborar o Plano de Desenvolvimento Institucional e demais planos, gerenciar o capital intelectual e demais recursos, fomentar o intercâmbio com a comunidade externa e fortalecer o entrosamento da comunidade interna, dentre outras.

O Reitor da UNIRIO (gestão 2023-2027) é o professor José da Costa Filho, nomeado por Decreto de 20 de junho de 2023.

Conforme o Estatuto da UNIRIO, a Reitoria é constituída por:

Gabinete do Reitor
Presta assistência direta ao Reitor, sendo responsável pela organização e execução dos trabalhos administrativos, além de ser responsável pela confecção e divulgação dos Boletins Internos, assim como pela disponibilização do Manual de Atos Oficiais, que trata, entre outros temas, do conceito, classificação e espécies de atos administrativos.

Vice-Reitoria

Pró-Reitoria de Graduação (Prograd)
Cria, desenvolve e consolida os cursos e as atividades do ensino de Graduação, além de viabilizar a integração com diferentes setores da sociedade, por meio de convênios com a finalidade de proporcionar estágio aos estudantes.

Pró-Reitoria de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação (PROPGPI)
Coordena a elaboração de políticas de desenvolvimento, sendo responsável por projetos e programas institucionais de pesquisa e inovação, além do ensino de Pós-Graduação.

Pró-Reitoria de Extensão e Cultura (Proexc)
É responsável pela formulação de políticas, gerência e avaliação de ações, projetos e programas da extensão universitária, e pela definição de uma política cultural para a Universidade.

Pró-Reitoria de Assuntos Estudantis (Prae)
Viabiliza a permanência dos estudantes em risco social e a redução dos efeitos das 12 desigualdades socioeconômicas no desempenho acadêmico, buscando a excelência na sua formação.

Pró-Reitoria de Planejamento (Proplan)
Promove a gestão universitária, com a padronização dos processos organizacionais e a simplificação das rotinas de trabalho, além de monitorar o PDI e os demais planos de acordo com a legislação vigente.

Pró-Reitoria de Administração (Proad)
Acompanha a execução do orçamento, além de supervisionar a gestão financeira e patrimonial.

Pró-Reitoria de Gestão de Pessoas (Progepe)
Planeja, coordena, fomenta e acompanha as atividades e as políticas voltadas ao desenvolvimento do servidor.

Auditoria Interna (Audin)
Instrui a Reitoria no exercício da supervisão e controle das atividades de administração contábil, financeira, técnica e administrativa.

Procuradoria-Geral (PG)
Representa a Universidade interna e externamente, além de desenvolver atividades de consultoria e assessoramento jurídico à Reitoria.

Coordenadoria de Comunicação Social (Comso)
Elabora e divulga matérias, interna e externamente, sobre o conhecimento produzido na Universidade, entre outras atividades.

Coordenadoria de Relações Internacionais e Interinstitucionais (CRI)
Estimula, apoia, planeja e executa o processo de internacionalização, por meio da mobilidade acadêmica e da cooperação internacional.

Coordenadoria de Educação a Distância (Cead)
Promove ações voltadas à viabilização de Cursos a distância e disciplinas na modalidade semipresencial.

Ouvidoria
Tem por objetivo principal ser o canal de comunicação direta entre o cidadão e a Instituição, mediando as necessidades e sugestões da comunidade interna e externa perante a UNIRIO.

Núcleo de Acessibilidade e Inclusão
Responsável por propor, avaliar e fiscalizar as demandas e providências inerentes ao processo de inclusão, permanência e acessibilidade das pessoas com deficiência, transtornos globais do desenvolvimento ou altas habilidades/superdotação na UNIRIO.

Núcleo Multidimensional de Correição
Unidade responsável pela coordenação, planejamento e organização das atividades correcionais da Reitoria, e por auxiliar e orientar as unidades da UNIRIO e outras comissões em assuntos correcionais..

Comissões e Comitês