Alimentos Funcionais - Visa o desenvolvimento de novos produtos alimentícios com ação funcional além da nutricional, promovendo a saúde de forma preventiva e curativa, além da abordagem completa sobre a atividade biológica dessas substâncias envolvendo estudos da sua biodisponibilidade, englobando a absorção, distribuição, o metabolismo, tempo de meia vida efetiva, os mecanismos de ativação e inativação e a excreção do composto em questão avaliando o potencial de aplicação, incluindo a suplementação alimentar, em estados de saúde, morbidades associadas e necessidades especiais.
Genética e Genômica Funcional - Esta linha de pesquisa agrega docentes que desenvolvem projetos de pesquisa em bioinformática, biologia molecular, genética, metagenômica, proteoma e transcriptoma. O objetivo final dos projetos dessa linha é o entendimento dos mecanismos moleculares, o estudo da importância da expressão gênica e do polimorfismo genético envolvidos em seu modelo de estudo.
Processamento, qualidade e valorização de alimentos, coprodutos e resíduos - Aplica a sustentabilidade na promoção da saúde desenvolvendo tecnologias no aproveitamento de resíduos na geração de alimentos, ingredientes e embalagens, com garantia da segurança alimentar. Esta linha visa atender aos desafios dos setores agrícola e industrial, considerando a necessidade do aumento da produção dos alimentos e o uso mais eficiente dos recursos naturais, produção de biomateriais e novas matérias-primas, tendo a bioeconomia como vertente de suas ações.
Controle de Qualidade em Alimentos - Avalia a qualidade físico-química de produtos alimentícios frescos e processados, visando a segurança alimentar.
Química e Bioquímica de Alimentos - Estuda constituintes químicos dos alimentos, alterações bioquímicas em produtos crus e processados, e biotecnologia.
Tecnologia de Produtos de Origem Vegetal - Análise de composição de alimentos, processos térmicos, de desidratação, de fermentação, desenvolvimento e otimização de processos e produtos.
Estudos proteômicos e metabolômicos por espectrometria de massas - Aplica a espectrometria de massas acoplada à cromatografia líquida e a gás para realizar análises do proteoma e do metaboloma de organismos, tecidos e alimentos.
Bioacessibilidade de compostos bioativos - Estudo da interação dos componentes químicos de uma matriz alimentícia, considerando processos e transformações da digestão humana.
Enzimas Microbianas - Esta linha de pesquisa tem por objetivo verificar e avaliar a produção de enzimas, principalmente de interesse para a indústria de alimentos, por diversos microrganismos.
Peptídeos Bioativos - Visa extrair e hidrolisar proteínas de origem animal, vegetal e microbiana para obtenção de peptídeos bioativos, por hidrólise enzimática, com vistas à sua aplicação em alimentos funcionais.
Estudo da dinâmica de polimerização e mecanismos de agregação de gluteninas do grão de trigo - Busca compreender os mecanismos bioquímicos e fisiológicos envolvidos durante o desenvolvimento do grão, identificar as diferentes modalidades de polimerização das gluteninas, bem como estudar a dinâmica de formação dos polímeros ao longo do desenvolvimento do grão de trigo.
Biotecnologia de Cacau e Chocolate - Esta linha de pesquisa tem por finalidade desenvolver tecnologias enzimáticas para melhoria da qualidade do liquor de cacau, principal matéria-prima da produção de chocolate.
Qualidade de Leite de Cabra - Avalia as características físico-químicas do leite de cabra produzido na região e as possíveis implicações destas variações na qualidade e na aplicação desta matéria prima.